Μια που είπες να περάσω τα windows από πάνω. Δεν το έχω κάνει ποτέ, δεν έχω ιδέα τι γίνεται; Χάνεις αρχεία με αυτή τη διαδικασία; Και μια δεύτερη ερώτηση, τι είναι το conflict; Να σου πω ότι το πρόβλημα το παρουσίασε τώρα τελευταία. Στην αρχή όλα πήγαιναν ρολόι.
Λοιπόν, κανονικά με το να ξαναπεράσεις τα windows δεν χάνεις αρχεία, απλά με λίγα λόγια είναι σαν να θέτεις το PC σου στα default settings του.. Βέβαια, μια φορά κατάφερα και έχασα όλα μου τα αρχεία αλλά ήταν μάλλον λάθος χειρισμός

.. Μην σε φοβίζω..
Λοιπόν για να εγκαταστήσεις τα windows (btw, εγκατέστησες τα τελευταία drivers για την κάρτα γραφικών σου, μπας και λύθηκε το πρόβλημα; ) καταρχάς βάλε στο cd-driver σου το cd των Windows.. Κάνε restart το PC σου και έπειτα θα κάνει autoboot το cd με τα Windows μόνο του.. Επέλεξε εγκατάσταση των Windows, και ακολούθησε τις οδηγίες του installation wizard (ήτοι οδηγός εγκατάστασης).. Πρόσεξε όμως σε περίπτωση που σε ρωτήσει να διαμορφώσει κάποιο διαμέρισμα μην την πατήσεις και επιλέξεις "ναι".. Καλύτερα αν δεν είσαι σίγουρος να μην επιλέγεις ναι.. Λογικά σε μια ώρα, θα τελειώσει η εγκατάσταση και το PC σου θα είναι ανάλαφρο σαν πούπουλο

.. Τα προγράμματα που χρησιμοποιούσες και εμφανίζονταν στο κάτω δεξί μέρος της οθόνης σου (msn, gtalk, καποιο printer application) θα πρέπει να τα εγκαταστήσεις ξανά δυστυχώς..
Το conflict που ανέφερα, με απλά λόγια μπορεί να περιγραφεί ως εξής.. Κάθε hardware που βάζεις στον υπολογιστή σου (κάρτα ήχου, κάρτα γραφικών, εξωτερικός σκληρός) πρέπει να επικοινωνεί με το PC σου μέσω των drivers.. Είναι δηλαδή σαν να πρέπει να κολλήσεις κάτι στον τοίχο.. Θέλεις κόλλα.. Αυτή η κόλλα κατά κάποιον τρόπο είναι τα drivers.. Πολλές φορές τα automatic updates των Windows που γίνονται χωρίς να τα καταλαβαίνουμε επηρεάζουν το configuration του PC μας με αποτέλεσμα τα υπάρχοντα drivers να πρέπει να προσαρμοστούνε στα νέα δεδομένα.. Γι'αυτό είναι πολύ βασικό να κάνουμε εγκατάσταση των τελευταίων drivers σε κάθε hardware που έχουμε (με εξαίρεση το bios, μην το επιχειρήσεις ποτέ, έχω δει υπολογιστή με λάθος bios upgrade να μην μπορεί να ανοίξει καν

)..
Καλή επιτυχία!! Δεν θέλει κόπο, τρόπο θέλει

P.S.: Αν κάποιο αρχείο/αρχεία το χρειάζεσαι πραγματικά, θα σου έλεγα να κρατήσεις κάποιο backup.. Ποτέ δεν ξέρεις τι γίνεται!!